Sau 5 ngày tranh tài, Đại hội thể thao người khuyết tật 2009 đã kết thúc tốt đẹp với màn trình diễn ấn tượng của đoàn Thái Lan. Tổng cộng, các vận động viên xứ Chùa Vàng đã giành tới 157 huy chương vàng, 75 huy chương bạc, và 57 huy chương đồng. Thành tích rực rỡ này vượt xa con số 94 HCV, 81 HCB, và 71 HCĐ của đoàn chủ nhà Malaysia. Cũng như Đại hội lần thứ 4 ở Thái Lan, đoàn Việt Nam đã giữ vững vị trí thứ 3 chung cuộc, với số huy chương vàng là 73, hơn đoàn đứng thứ 4, Indonesia tới 44 HCV. Xếp ở vị trí cuối cùng tại Đại hội là đoàn Lào, chỉ với 1 HCB và 1 HCĐ.
Cũng trong lễ bế mạc, Ban tổ chức Asean Para Games 5 đã trao danh hiệu VĐV nữ xuất sắc nhất cho kình ngư Nguyễn Thị Sa Ri, người đã giành 3 HCV cho đoàn Việt Nam, đồng thời phá 2 kỷ lục ở nội dung 100m ếch và 50m ếch. Danh hiệu VĐV nam xuất sắc nhất thuộc về tay vợt cầu lông Dumnern Junthong của Thái Lan.
Ngọn lửa Đại hội Asean Para Games lần thứ 5 đã tắt, và lá cờ truyền thống tôn vinh những anh hùng khuyết tật đã được trao cho đại diện Indonesia, quốc gia sẽ tổ chức Đại hội lần thứ 6 – Jakarta 2011.